Les mycotoxines représentent une menace cachée, et sont probablement responsables de nombreux problèmes de santé non diagnostiqués chez les animaux d'élevage du monde entier. Pour la plupart des éleveurs, le résultat de la présence de mycotoxines est plus susceptible d'être considéré comme un problème chronique qui se produit sur une période plus longue mais qui ne se traduit pas toujours par des symptômes aigus. Quoi qu'il en soit, dans tous les cas, le résultat sera une baisse des performances et un manque à gagner.
Les différentes mycotoxines auront des toxicités, des modes d'action et des effets sanitaires variables sur les différentes espèces, ce qui affectera les résultats de toute exploitation d'élevage de plusieurs manières :
